Protein–RNA interactions for Protein: Q8N118

CYP4X1, Cytochrome P450 4X1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4X1Q8N118 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP4X1Q8N118 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP4X1Q8N118 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP4X1Q8N118 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP4X1Q8N118 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP4X1Q8N118 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP4X1Q8N118 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP4X1Q8N118 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP4X1Q8N118 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP4X1Q8N118 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4X1Q8N118 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4X1Q8N118 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4X1Q8N118 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4X1Q8N118 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4X1Q8N118 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4X1Q8N118 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4X1Q8N118 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4X1Q8N118 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4X1Q8N118 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4X1Q8N118 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4X1Q8N118 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4X1Q8N118 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4X1Q8N118 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4X1Q8N118 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4X1Q8N118 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYP4X1Q8N118 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CYP4X1Q8N118 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYP4X1Q8N118 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP4X1Q8N118 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CYP4X1Q8N118 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CYP4X1Q8N118 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4X1Q8N118 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4X1Q8N118 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4X1Q8N118 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4X1Q8N118 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4X1Q8N118 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4X1Q8N118 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms