Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
P3H3Q8IVL6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
P3H3Q8IVL6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
P3H3Q8IVL6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
P3H3Q8IVL6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
P3H3Q8IVL6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
P3H3Q8IVL6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
P3H3Q8IVL6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
P3H3Q8IVL6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
P3H3Q8IVL6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
P3H3Q8IVL6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
P3H3Q8IVL6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.35■■■■□ 3.41
P3H3Q8IVL6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
P3H3Q8IVL6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
P3H3Q8IVL6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
P3H3Q8IVL6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
P3H3Q8IVL6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
P3H3Q8IVL6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
P3H3Q8IVL6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
P3H3Q8IVL6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
P3H3Q8IVL6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
P3H3Q8IVL6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
P3H3Q8IVL6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
P3H3Q8IVL6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
P3H3Q8IVL6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
P3H3Q8IVL6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
P3H3Q8IVL6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
P3H3Q8IVL6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
P3H3Q8IVL6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
P3H3Q8IVL6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
P3H3Q8IVL6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
P3H3Q8IVL6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC36.33■■■■□ 3.41
P3H3Q8IVL6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
P3H3Q8IVL6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
P3H3Q8IVL6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.29■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC36.26■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
P3H3Q8IVL6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
P3H3Q8IVL6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
P3H3Q8IVL6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
P3H3Q8IVL6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
P3H3Q8IVL6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
P3H3Q8IVL6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
P3H3Q8IVL6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
P3H3Q8IVL6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
P3H3Q8IVL6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
P3H3Q8IVL6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
P3H3Q8IVL6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
P3H3Q8IVL6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
P3H3Q8IVL6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
P3H3Q8IVL6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
P3H3Q8IVL6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
P3H3Q8IVL6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
P3H3Q8IVL6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
P3H3Q8IVL6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
P3H3Q8IVL6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
P3H3Q8IVL6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
P3H3Q8IVL6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
P3H3Q8IVL6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
P3H3Q8IVL6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
P3H3Q8IVL6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
P3H3Q8IVL6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
P3H3Q8IVL6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
P3H3Q8IVL6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
P3H3Q8IVL6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
P3H3Q8IVL6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
P3H3Q8IVL6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms