Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB11FIP4Q86YS3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
RAB11FIP4Q86YS3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RAB11FIP4Q86YS3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RAB11FIP4Q86YS3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB11FIP4Q86YS3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB11FIP4Q86YS3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB11FIP4Q86YS3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB11FIP4Q86YS3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB11FIP4Q86YS3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB11FIP4Q86YS3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB11FIP4Q86YS3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB11FIP4Q86YS3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB11FIP4Q86YS3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB11FIP4Q86YS3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB11FIP4Q86YS3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB11FIP4Q86YS3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB11FIP4Q86YS3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB11FIP4Q86YS3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB11FIP4Q86YS3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB11FIP4Q86YS3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB11FIP4Q86YS3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB11FIP4Q86YS3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB11FIP4Q86YS3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB11FIP4Q86YS3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB11FIP4Q86YS3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB11FIP4Q86YS3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB11FIP4Q86YS3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB11FIP4Q86YS3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB11FIP4Q86YS3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RAB11FIP4Q86YS3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
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