Protein–RNA interactions for Protein: Q86YH6

PDSS2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS2Q86YH6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDSS2Q86YH6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDSS2Q86YH6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms