Protein–RNA interactions for Protein: Q86XE0

SNX32, Sorting nexin-32, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX32Q86XE0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX32Q86XE0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX32Q86XE0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms