Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT5

PDZD3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD3Q86UT5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZD3Q86UT5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms