Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMC3Q7Z5M5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMC3Q7Z5M5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms