Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms