Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYFIP1Q7L576 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYFIP1Q7L576 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYFIP1Q7L576 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CYFIP1Q7L576 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYFIP1Q7L576 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYFIP1Q7L576 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYFIP1Q7L576 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms