Protein–RNA interactions for Protein: Q71UM5

RPS27L, 40S ribosomal protein S27-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27LQ71UM5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPS27LQ71UM5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms