Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BEND4Q6ZU67 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BEND4Q6ZU67 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms