Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP12Q6UXS9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms