Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCIMPQ6UWF3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms