Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW10

SFTA2, Surfactant-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA2Q6UW10 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFTA2Q6UW10 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTA2Q6UW10 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTA2Q6UW10 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTA2Q6UW10 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTA2Q6UW10 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFTA2Q6UW10 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms