Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5X5

C22orf39, UPF0545 protein C22orf39, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C22orf39Q6P5X5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C22orf39Q6P5X5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C22orf39Q6P5X5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms