Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GDF6Q6KF10 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GDF6Q6KF10 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GDF6Q6KF10 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms