Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQQ9

OTUD7B, OTU domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD7BQ6GQQ9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
OTUD7BQ6GQQ9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
OTUD7BQ6GQQ9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
OTUD7BQ6GQQ9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
OTUD7BQ6GQQ9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
OTUD7BQ6GQQ9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
OTUD7BQ6GQQ9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
OTUD7BQ6GQQ9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
OTUD7BQ6GQQ9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
OTUD7BQ6GQQ9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
OTUD7BQ6GQQ9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
OTUD7BQ6GQQ9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
OTUD7BQ6GQQ9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
OTUD7BQ6GQQ9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
OTUD7BQ6GQQ9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
OTUD7BQ6GQQ9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
OTUD7BQ6GQQ9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
OTUD7BQ6GQQ9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
OTUD7BQ6GQQ9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
OTUD7BQ6GQQ9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms