Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZY7

SCARA3, Scavenger receptor class A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3Q6AZY7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCARA3Q6AZY7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms