Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USPL1Q5W0Q7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USPL1Q5W0Q7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms