Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD13Q5VXD3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD13Q5VXD3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms