Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
STRIP1Q5VSL9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRIP1Q5VSL9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRIP1Q5VSL9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRIP1Q5VSL9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRIP1Q5VSL9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRIP1Q5VSL9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRIP1Q5VSL9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRIP1Q5VSL9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRIP1Q5VSL9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRIP1Q5VSL9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRIP1Q5VSL9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
STRIP1Q5VSL9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
STRIP1Q5VSL9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRIP1Q5VSL9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
STRIP1Q5VSL9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRIP1Q5VSL9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRIP1Q5VSL9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRIP1Q5VSL9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRIP1Q5VSL9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRIP1Q5VSL9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRIP1Q5VSL9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRIP1Q5VSL9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms