Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMD4BQ5PRF9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms