Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB41Q5JT25 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAB41Q5JT25 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB41Q5JT25 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms