Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRA6

MIA3, Transport and Golgi organization protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIA3Q5JRA6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIA3Q5JRA6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MIA3Q5JRA6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MIA3Q5JRA6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIA3Q5JRA6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIA3Q5JRA6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIA3Q5JRA6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIA3Q5JRA6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIA3Q5JRA6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIA3Q5JRA6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIA3Q5JRA6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIA3Q5JRA6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIA3Q5JRA6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIA3Q5JRA6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MIA3Q5JRA6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIA3Q5JRA6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIA3Q5JRA6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIA3Q5JRA6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MIA3Q5JRA6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIA3Q5JRA6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIA3Q5JRA6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIA3Q5JRA6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIA3Q5JRA6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIA3Q5JRA6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIA3Q5JRA6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIA3Q5JRA6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIA3Q5JRA6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIA3Q5JRA6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIA3Q5JRA6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIA3Q5JRA6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIA3Q5JRA6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIA3Q5JRA6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIA3Q5JRA6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIA3Q5JRA6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIA3Q5JRA6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MIA3Q5JRA6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MIA3Q5JRA6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms