Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN68

LINC01620, Uncharacterized protein encoded by LINC01620, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01620Q4KN68 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01620Q4KN68 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms