Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UVSSAQ2YD98 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UVSSAQ2YD98 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms