Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RTL8BQ17RB0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTL8BQ17RB0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
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