Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
IMPG1Q17R60 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
IMPG1Q17R60 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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