Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ECM1Q16610 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
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