Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEBPEQ15744 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEBPEQ15744 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEBPEQ15744 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CEBPEQ15744 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CEBPEQ15744 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CEBPEQ15744 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEBPEQ15744 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEBPEQ15744 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CEBPEQ15744 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CEBPEQ15744 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEBPEQ15744 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEBPEQ15744 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CEBPEQ15744 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEBPEQ15744 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CEBPEQ15744 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEBPEQ15744 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CEBPEQ15744 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEBPEQ15744 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CEBPEQ15744 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEBPEQ15744 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEBPEQ15744 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CEBPEQ15744 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CEBPEQ15744 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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