Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALX1Q15699 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
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