Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF1AQ15573 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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