Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP1Q15431 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
SYCP1Q15431 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
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