Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLR1Q15399 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms