Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPAQ15257 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPAQ15257 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPAQ15257 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPAQ15257 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPAQ15257 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPAQ15257 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPAQ15257 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPAQ15257 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPAQ15257 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPAQ15257 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPAQ15257 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPAQ15257 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPAQ15257 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPAQ15257 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPAQ15257 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPAQ15257 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPAQ15257 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPAQ15257 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPAQ15257 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPAQ15257 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPAQ15257 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPAQ15257 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPAQ15257 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPAQ15257 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPAQ15257 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPAQ15257 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPAQ15257 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPAQ15257 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPAQ15257 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPAQ15257 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPAQ15257 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPAQ15257 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPAQ15257 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPAQ15257 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPAQ15257 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPAQ15257 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPAQ15257 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPAQ15257 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPAQ15257 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPAQ15257 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPAQ15257 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPAQ15257 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPAQ15257 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPAQ15257 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPAQ15257 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPAQ15257 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPAQ15257 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
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