Protein–RNA interactions for Protein: Q15024

EXOSC7, Exosome complex component RRP42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC7Q15024 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC7Q15024 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms