Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNAB1Q14722 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNAB1Q14722 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNAB1Q14722 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNAB1Q14722 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNAB1Q14722 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNAB1Q14722 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNAB1Q14722 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNAB1Q14722 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNAB1Q14722 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNAB1Q14722 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNAB1Q14722 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNAB1Q14722 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNAB1Q14722 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNAB1Q14722 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
KCNAB1Q14722 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
KCNAB1Q14722 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCNAB1Q14722 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNAB1Q14722 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNAB1Q14722 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNAB1Q14722 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNAB1Q14722 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNAB1Q14722 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNAB1Q14722 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNAB1Q14722 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNAB1Q14722 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNAB1Q14722 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNAB1Q14722 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNAB1Q14722 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNAB1Q14722 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNAB1Q14722 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNAB1Q14722 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNAB1Q14722 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNAB1Q14722 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNAB1Q14722 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNAB1Q14722 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNAB1Q14722 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNAB1Q14722 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNAB1Q14722 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNAB1Q14722 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNAB1Q14722 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNAB1Q14722 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNAB1Q14722 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNAB1Q14722 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNAB1Q14722 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNAB1Q14722 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNAB1Q14722 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNAB1Q14722 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms