Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SSPNQ14714 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSPNQ14714 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSPNQ14714 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
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