Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM25Q14258 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRIM25Q14258 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM25Q14258 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM25Q14258 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM25Q14258 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.4 ms