Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
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TNFAIP1Q13829 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
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TNFAIP1Q13829 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
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