Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACNA1SQ13698 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACNA1SQ13698 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACNA1SQ13698 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACNA1SQ13698 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACNA1SQ13698 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACNA1SQ13698 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACNA1SQ13698 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CACNA1SQ13698 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CACNA1SQ13698 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CACNA1SQ13698 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CACNA1SQ13698 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CACNA1SQ13698 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CACNA1SQ13698 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CACNA1SQ13698 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CACNA1SQ13698 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNA1SQ13698 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNA1SQ13698 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNA1SQ13698 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNA1SQ13698 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNA1SQ13698 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNA1SQ13698 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNA1SQ13698 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNA1SQ13698 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNA1SQ13698 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNA1SQ13698 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CACNA1SQ13698 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CACNA1SQ13698 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CACNA1SQ13698 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CACNA1SQ13698 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CACNA1SQ13698 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CACNA1SQ13698 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CACNA1SQ13698 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CACNA1SQ13698 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
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