Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAE1Q13564 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NAE1Q13564 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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