Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EIF4EBP1Q13541 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EIF4EBP1Q13541 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF4EBP1Q13541 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF4EBP1Q13541 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF4EBP1Q13541 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF4EBP1Q13541 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF4EBP1Q13541 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF4EBP1Q13541 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF4EBP1Q13541 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF4EBP1Q13541 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF4EBP1Q13541 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF4EBP1Q13541 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF4EBP1Q13541 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF4EBP1Q13541 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF4EBP1Q13541 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF4EBP1Q13541 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF4EBP1Q13541 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF4EBP1Q13541 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF4EBP1Q13541 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF4EBP1Q13541 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF4EBP1Q13541 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF4EBP1Q13541 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF4EBP1Q13541 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EIF4EBP1Q13541 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EIF4EBP1Q13541 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EIF4EBP1Q13541 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EIF4EBP1Q13541 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EIF4EBP1Q13541 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EIF4EBP1Q13541 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EIF4EBP1Q13541 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF4EBP1Q13541 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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