Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED1Q13445 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
TMED1Q13445 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMED1Q13445 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMED1Q13445 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMED1Q13445 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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