Protein–RNA interactions for Protein: Q13113

PDZK1IP1, PDZK1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1IP1Q13113 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDZK1IP1Q13113 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PDZK1IP1Q13113 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDZK1IP1Q13113 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDZK1IP1Q13113 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDZK1IP1Q13113 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDZK1IP1Q13113 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDZK1IP1Q13113 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDZK1IP1Q13113 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PDZK1IP1Q13113 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDZK1IP1Q13113 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDZK1IP1Q13113 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDZK1IP1Q13113 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDZK1IP1Q13113 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDZK1IP1Q13113 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDZK1IP1Q13113 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PDZK1IP1Q13113 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDZK1IP1Q13113 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDZK1IP1Q13113 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDZK1IP1Q13113 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDZK1IP1Q13113 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDZK1IP1Q13113 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PDZK1IP1Q13113 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDZK1IP1Q13113 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms