Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
TRAF1Q13077 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRAF1Q13077 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
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