Protein–RNA interactions for Protein: Q12010

YPQ1, Probable vacuolar amino acid transporter YPQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPQ1Q12010 YPR109WYPR109W 885 nt4.59□□□□□ -1.67
YPQ1Q12010 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt4.59□□□□□ -1.67
YPQ1Q12010 AAD4YDL243C 990 nt4.58□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 YKR104WYKR104W 921 nt4.58□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 PWP1YLR196W 1731 nt4.58□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 NMD3YHR170W 1557 nt4.57□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 CAF4YKR036C 1932 nt4.57□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 CPR4YCR069W 957 nt4.57□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 SNA2YDR525W-A 240 nt4.57□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 KRE28YDR532C 1158 nt4.57□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 YEL067CYEL067C 588 nt4.57□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt4.57□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 YIL165CYIL165C 360 nt4.57□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 YJL193WYJL193W 1209 nt4.57□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 ISY1YJR050W 708 nt4.57□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 FRS1YLR060W 1788 nt4.57□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 RAD53YPL153C 2466 nt4.56□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 PHM8YER037W 966 nt4.56□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 COA3YJL062W-A 258 nt4.56□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 YKL023WYKL023W 834 nt4.56□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 RFU1YLR073C 603 nt4.56□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 RPC19YNL113W 429 nt4.56□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 snR19snR19 568 nt4.56□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 MCM4YPR019W 2802 nt4.56□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 RGT1YKL038W 3513 nt4.56□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 MET3YJR010W 1536 nt4.56□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 RRN3YKL125W 1884 nt4.56□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 RCK2YLR248W 1833 nt4.56□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 MET12YPL023C 1974 nt4.55□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 ARG82YDR173C 1068 nt4.55□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 YER145C-AYER145C-A 438 nt4.55□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 YGL088WYGL088W 366 nt4.55□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 YIR043CYIR043C 693 nt4.55□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 YOR379CYOR379C 339 nt4.55□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 MAK3YPR051W 531 nt4.55□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 MCX1YBR227C 1563 nt4.55□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 PCL8YPL219W 1479 nt4.55□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 LAP2YNL045W 2016 nt4.55□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 ATG1YGL180W 2694 nt4.54□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 GSY1YFR015C 2127 nt4.54□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 AFT1YGL071W 2073 nt4.54□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 ARP10YDR106W 855 nt4.54□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 UBC8YEL012W 657 nt4.54□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 FMP48YGR052W 1110 nt4.54□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 YIL028WYIL028W 399 nt4.54□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 PML1YLR016C 615 nt4.54□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 YLR346CYLR346C 306 nt4.54□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 CSR1YLR380W 1227 nt4.54□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 SMA1YPL027W 738 nt4.54□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 RER1YCL001W 567 nt4.54□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 RRB1YMR131C 1536 nt4.54□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 GDH2YDL215C 3279 nt4.54□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 IML2YJL082W 2196 nt4.53□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 FRA2YGL220W 363 nt4.53□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 YCL012CYCL012C 405 nt4.53□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 CYK3YDL117W 2658 nt4.53□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 SED4YCR067C 3198 nt4.53□□□□□ -1.68
YPQ1Q12010 YNL095CYNL095C 1929 nt4.52□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 TIP41YPR040W 1071 nt4.52□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 EXO1YOR033C 2109 nt4.51□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 SRN2YLR119W 642 nt4.51□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 OCA1YNL099C 717 nt4.51□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 CBP1YJL209W 1965 nt4.51□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 YGR122WYGR122W 1209 nt4.5□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 MRPL20YKR085C 588 nt4.5□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 RSA3YLR221C 663 nt4.5□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 YOL035CYOL035C 303 nt4.5□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 ECM33YBR078W 1290 nt4.5□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 OCA5YHL029C 2040 nt4.5□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 PMT2YAL023C 2280 nt4.49□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 DBF4YDR052C 2115 nt4.49□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 WTM2YOR229W 1404 nt4.49□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 PAU17YLL025W 375 nt4.49□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 TAF5YBR198C 2397 nt4.49□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 SIP5YMR140W 1470 nt4.49□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 SNF3YDL194W 2655 nt4.49□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 STE7YDL159W 1548 nt4.48□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 RAD28YDR030C 1521 nt4.48□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 TSL1YML100W 3297 nt4.48□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 GIP2YER054C 1647 nt4.48□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 CNB1YKL190W 528 nt4.48□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt4.48□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 RMI1YPL024W 726 nt4.48□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 YPL113CYPL113C 1191 nt4.48□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 SMP1YBR182C 1359 nt4.48□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 MSC2YDR205W 2175 nt4.48□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 PXA1YPL147W 2613 nt4.47□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 LHP1YDL051W 828 nt4.47□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 DPB4YDR121W 591 nt4.47□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 PIC2YER053C 903 nt4.47□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 YKL169CYKL169C 384 nt4.47□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 ROT1YMR200W 771 nt4.47□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 RRP40YOL142W 723 nt4.47□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 SPO19YPL130W 672 nt4.47□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 CDC28YBR160W 897 nt4.47□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 APL6YGR261C 2430 nt4.47□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 ARH1YDR376W 1482 nt4.47□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 SAP155YFR040W 3009 nt4.47□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 TFG1YGR186W 2208 nt4.46□□□□□ -1.69
YPQ1Q12010 IXR1YKL032C 1794 nt4.46□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.8 ms