Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNEQ04844 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNEQ04844 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms