Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN1Q04323 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN1Q04323 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms