Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSC2Q02487 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSC2Q02487 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms